E mais um novo capítulo de Operações Especiais foi liberado em Avengers Alliance, baseado na saga dos Quadrinhos Vingadores Vs X-Men. No entanto o jogo possui uma cronologia própria e neste novo capítulo uma das mudanças mais marcantes em relação aos quadrinhos fica por conta de Jean Grey como um membro do Cinco da Fênix, substituindo Namor.
No entanto assim como nos quadrinhos Jean também ganhou um novo traje para o jogo, com um estilo bem similar ao de Ciclope, Colossus, Emma Frost, e Magia.
Magia que por sinal é a recompensa do capítulo especial, porém curiosamente, não há uma versão da personagem sem o traje dos Cinco da Fênix. O Capítulo do jogo segue o modelo do segundo, onde a cada 5 tarefas o jogador ganha um novo item exclusivo.
Para cada um dos personagens que estiverem usando o traje dos Cinco da Fênix uma nova habilidade exclusiva é adquirida como regeneração de energia ou ataques coordenados. Além disso, pela primeira vez, os jogadores irão se aventurar além de Nova York para explorar locais de San Francisco, como a Golden Gate Bridge e Alcatraz assim como Utopia – a nação dos X-Men e do celeste sonhador.
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